2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。李奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普利尔·奥尼尔…

一次偶然中，瑞格（梅尔·吉布森 Mel Gibson 饰）与莫道（丹尼·格洛弗 Danny Glover 饰）这对好搭档撞破了一起走私南非金币的违法勾当，正义感爆棚的两人决心绝不对此坐视不管，于是展开了一系列充满了进场刺激的火爆追击。　　随着调查的深入，一个名叫艾金（乔斯·雅克兰德 Joss Ackland 饰）的男人浮出了水面，他的真实身份竟然是享有外交豁…