在不久未來，日本社會淪為貧民窟。隸屬於政府特務組織「極樂」的亞矢和她的夥伴小夏等人，試圖擊倒巨大的跨國企業黑田財閥。她們是「Lady Ninja」。然而，最強的敵人「夜叉」出現在亞矢一行人面前，誰能夠生存下來？無數的強敵、隨時可能喪命的事件、期待和背叛、友情和愛情，事件的真相究竟為何……？賭上國家的未來，女忍者們的戰爭即將開始……